Pada sesi latihan bebas kedua MotoGP Jepang, para pembalap kelas premier memperlihatkan semangat yang tinggi untuk saling menyalip di trek yang panas. Francesco Bagnaia dan Pedro Acosta terlihat dominan di awal sesi, sementara Marc Marquez agak lambat dan berada di posisi ke-14. Hal ini berbeda dengan sang adik, Alex Marquez, yang berhasil menempati posisi ketiga.
Honda turut menunjukkan performa impresif dengan menempatkan empat pembalapnya di 10 besar. Pembalap tes Takaaki Nakagami bahkan berhasil menempati posisi ketiga di atas Joan Mir, Luca Marini, dan Johann Zarco. Namun, saat Bagnaia kembali ke garasinya, Marquez mampu merebut posisi pertama dengan waktu 1:44,321 sebelum mengalami kecelakaan di Tikungan 5.
Meskipun mengalami insiden, Marquez berhasil kembali ke pit dengan kerusakan di sisi kiri. Sementara itu, Bagnaia mampu memperbaiki posisinya dan naik ke peringkat kedua diikuti oleh Fermin Aldeguer, Brad Binder, dan Miguel Oliveira. Pedro Acosta juga menunjukkan kecepatan dengan meraih posisi teratas diakhir sesi, diikuti oleh Ai Ogura, Bagnaia, dan Marquez.
Hasil FP2 MotoGP Jepang menunjukkan persaingan yang ketat di antara para pembalap top. Acosta, Ogura, Marquez, Bagnaia, Morbidelli, Luca Marini, Marco Bezzecchi, Takaaki Nakagami, Fabio Quartararo, dan Alex Marquez menjadi 10 besar pada sesi tersebut.
