Lando Norris dan Oscar Piastri telah menunjukkan kecepatan mereka selama sesi latihan, namun Max Verstappen tampil gemilang dengan mencatatkan rekor waktu baru 1:26,983 untuk meraih pole position di Suzuka untuk keempat kalinya berturut-turut. Pemimpin klasemen sementara, Norris, akan memulai balapan dari posisi kedua setelah hanya terpaut 0,012 detik dari Verstappen, sementara Piastri, pemenang Grand Prix China, berada di posisi ketiga bersama Charles Leclerc. Sebelum Verstappen memperlihatkan penampilan impresifnya, Mercedes diharapkan untuk bersaing ketat dengan duo McLaren, tetapi George Russell dan Andrea Kimi Antonelli hanya mampu meraih baris ketiga.
Keputusan Red Bull untuk menggantikan Liam Lawson dengan Yuki Tsunoda menuju Jepang telah menjadi sorotan, namun keduanya terhenti di Q1. Debutan dari Racing Bull, Isack Hadjar, berhasil menempati posisi ketujuh namun terdapat laporan mengenai masalah di kokpit selama sesi pembukaan. Lewis Hamilton harus puas memulai balapan dari posisi kedelapan, diikuti oleh Alex Albon dari Williams dan pembalap Haas, Oliver Bearman.
Sesi yang berlangsung selama satu jam ini dilanda insiden kebakaran rumput di pinggir lintasan yang menyebabkan penundaan di Q2. Setelah insiden tersebut ditangani, beberapa perbaikan dilakukan di berbagai bagian lintasan, akhirnya Lawson dan Tsunoda tereliminasi. Lawson akan start dari posisi ke-14, di depan rekan setimnya di Red Bull, sedangkan Pierre Gasly, Carlos Sainz, dan Fernando Alonso juga tidak bisa masuk ke 10 besar. Selain itu, Esteban Ocon harus puas memulai balapan dari posisi ke-18 setelah tidak mampu menandingi kecepatan Bearman di Haas. Lance Stroll juga mengalami sesi yang menyedihkan, keluar dari lintasan sehingga harus start dari belakang, sementara mobil Alpine milik Jack Doohan telah diperbaiki setelah insiden di sesi latihanhari Jumat.
